潜在変数へ向けて１（とりあえずインストールまで）

stat R言語 Excel

「独立連鎖モデル」というのを作るのに、「グラフィカルモデリング」というのをやってみたい。
MIMというソフトがあって、それが使えるかどうかわからないけど、どうやらmimRというパッケージをつかえばR越しにMIMを使用できるとのことで（ただしWinのみ）、まあものは試しにインストールまではやってみようと思う。
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まず、mimRをインストール。これは普通に会津や筑波のサーバからダウンロードできる。で、これをダウンロード中に「dependency ''RDCOMClient'' is not available」と出る。実際、mimRをロードしようとしてもエラーが出る：

> library(mimR)
要求されたパッケージ RDCOMClient をロード中です
エラー：パッケージ 'RDCOMClient' をロードできませんでした
追加情報: Warning message:
'RDCOMClient' という名前のパッケージはありません in: library(pkg, character.only = TRUE, logical = TRUE, lib.loc = lib.loc)

そこでRDCOMClientをインストールする。これはhttp://www.omegahat.org/からダウンロード可能。Win版ならGUIメニューから「パッケージ」→「ダウンロードサイトの選択」→「Omegahat」を選択、同様に「パッケージのインストール」でインストール可能。
RDCOMClientをインストールした後にmimRをロードすると、ちゃんと読み込める：

> library(mimR)
要求されたパッケージ RDCOMClient をロード中です

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mimR: A package for graphical modelling in R
mimR, version 1.2.7 is now loaded
Copyright (C) 2002, S?en H?sgaard
Maintained by S?en H?sgaard <sorenh@agrsci.dk> 
Webpage: http://genetics.agrsci.dk/~sorenh/mimR 

Built: R 2.2.0; ; 2005-10-14 14:38:16; windows 
NOTICE:
o mimR is available on Windows platforms only 
o The current version of mimR requires that 
  - R version 2.1.1 or later is used
  - MIM version 3.2 or later is installed on the computer
    MIM can be downloaded from http://www.hypergraph.dk.
  - the R package RDCOMClient package is installed.
o mimR will automatically start the MIM program if not already running. 
  However, mimR sometimes runs more smoothly if the user starts MIM manually.

  For more information type ?mimR
-------------------------------------------------------------

次のパッケージを付け加えます: 'mimR'


        The following object(s) are masked from package:stats :

         simulate 

> setRepositories()

以下はmimRのヘルプ：

mimR                  package:mimR                  R Documentation

The package 'mimR': summary information

Description:

     This package provides an interface to the MIM program for
     inference in mixed graphical models.

Details:

        *  mimR is available on Windows platforms only.

        *  mimR requires that the MIM program is installed on the
           computer.

        *  MIM can be downloaded from http://www.hypergraph.dk.

        *  mimR requires that the R package 'RDCOMClient' is installed.

        *  For information about required versions of R and MIM, please
           see the information presented when mimR is loaded.

        *  mimR will automatically start the MIM program if not already
           running.  However, mimR sometimes runs more smoothly if the
           user starts MIM manually.

        *  The mimR package comes with a small users manual.

        *  To start using mimR you must do library(mimR)

     The package is intended as a contribution to the gR-project 
     derscribed by Lauritzen (2002).

Authors:

     S?en H?sgaard, Biometry Research Unit, Danish Institute of
     Agricultural Sciences, DK-8830 Tjele, Denmark

Acknowledgements:

     Thanks to David Edwards, the creator of the MIM program.

References:

     Lauritzen, S. L. (2002). gRaphical Models in R. _R News_, 3(2)39.

作者の名前が文字化けしてますが、その部分はOにスラッシュの、セーレン・キルケゴールの名前に出てくる例のあれ。デンマーク人だなあ。ていうか文字化けすんなよ。
mimRパッケージのdocフォルダにHojsgaard氏（oにスラッシュね）の論文とマニュアルがあるので、眺めておく。